Термін зберігання яєць починається від дати, коли воно було знесено, а не від дати сортування, яку вказують на шкаралупі. Але яйця повинні при цьому мати цілу, нетріснуту шкаралупу.
Зберігати яйця краще в холодильнику, це дозволить уникнути розмноження патогенних мікроорганізмів.
Термін зберігання дієтичних яєць до 7 діб, столових яєць від 8 до 25 днів. Миті яйця зберігаються не більше 12 днів.
Рекомендується тримати яйця гострим кінцем вниз, щоб жовток залишався в центрі і не торкався повітряного шару, що заповнює тупий кінець. У такому положенні вони краще зберігаються.